Introduzione alla biologia molecolare della cellula.
Tecniche molecolari per lo studio degli acidi nucleici
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio del Genoma
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio del Trascrittoma
Approcci sperimentali/computazionali per lo studio dell’ Epigenoma
Integromica e Network Biology
Come materiale didattico saranno fornite dal docente le diapositive delle lezioni
Obiettivi Formativi
Conoscere le principali tecniche sperimentali “omiche” per lo studio del genoma, metiloma, trascrittoma e proteoma e gli approcci computazionali per analizzare e integrare i dati generati da tali tecniche.
Prerequisiti
Conoscenze di algebra lineare e teoria delle probabilità sono utili ma non strettamente necessarie.
Metodi Didattici
Lezioni teorico/pratiche ed esercitazioni in laboratorio di informatica (a piccoli gruppi).
Modalità di verifica apprendimento
Esame orale sul programma svolto, eventualmente preceduto dall'esposizione di una tesina scritta.
Programma del corso
Wet Biology
Introduzione alla biologia molecolare della cellula.
DNA, RNA, Proteine.
Dogma Centrale, meccanismi di regolazione (replicazione, trascrizione e traduzione) e modificazioni del genoma.
Tecniche molecolari per lo studio degli acidi nucleici
PCR
Real time PCR
Elettroforesi
Sanger Sequencing
Microarray
Sequenziamento di seconda generazione
Sequenziamento di terza generazione
Dry Biology
Genomica
Il genoma umano
Classificazione delle varianti genomiche
Tecnologie array per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di seconda generazione per lo studio della varianti genomiche
Tecnologie di sequenziamento di terza generazione per lo studio della varianti genomiche
Trascrittomica
Il trascrittoma umano
Tecniche array per lo studio dell’espressione genica
Tecniche di sequenziamento per lo studio dell’espressione genica.
Metodi statistici per lo studio dell’espressione differenziale.
Clustering per l’identificazione di geni coespressi.
Enrichment analysis.
Epigenomica
Le modificazioni del genoma umano.
Tecniche array e tecniche di sequenziamento per lo studio del metiloma.
Metodi computazionali per lo studio delle regioni differenziamento metilate.
Network Biology
Introduzione alle tecniche per lo studio dell’interazione funzionale proteina-proteina (Yeast-two hybrid, Synthetic Lethality, Synthetic Rescue, ).
Concetti di Functional coupling. Elementi di network theory. Elementi di network medicine.